POP3でStatusヘッダがROだったら受信したときに既読にしてしまうという機能があるとうれしい人がいるかもしれませんね。
受信した後に振り分けで既読フラグを立てるというのが、割とQMAILらしい対処の仕方かなと思うのですが、機能として入っていてもいいんじゃないかと思っています。
ちなみに、振り分けでやるとしたら、
@If(@Equal(Status, 'RO'), @Progn(@Seen(@True()), @True()), @True())
で現在のフォルダに振り分ける、という感じになるんでしょうか。