ルートフォルダの指定機能は元々UW-IMAPでホームディレクトリ以下のファイルがすべて見えてしまうのに対処するために付いています。なので、Courier-IMAPでは指定することはなかったのですが、ためしにInboxをルートフォルダに指定してみました。というのは、Courier-IMAPの場合にはInboxの下にしかフォルダを作成することができないのですが、ルートフォルダにInboxを指定すれば、Inboxの子フォルダがInboxと並んで表示されるようになるからです*1。
ルートフォルダを指定した場合には、そのセパレータが「/」固定になっていてフォルダの作成がうまくいかないなどの問題がありましたが、そのあたりを修正したらうまく動いているようです。
しかし、最近はInboxだけ見えていたほうが調子が良いことが多いので、このまま使い続けるかは微妙です。
*1 ちなみに、NAMESPACEコマンドを送ると、INBOXがパーソナルなネームスペースになっています