TC's blogからリンクされていたのでさらっと目を通したのですが、スレッドごと既読にできる機能があると確かに便利かもしれません。
任意のマクロを実行できる（メニューのparamパラメータで指定できるようにする）ようにして、マクロでやるのがQMAILっぽいでしょうか。その前に、@Threadが必要ですけど。
@Foreach(@Thread(), @Seen(@True()))
のように書くということですね。