いつもスタートメニューから[終了オプション]を選んでから終了のダイアログが出るまでに数分（長いと5分以上）かかるのですが、これで解決するのでしょうか？ためしに入れてみました。
Windows VistaのNTFSではトランザクションが使えるという話。DBを使わなくてもファイルレベルでアトミック性が確保できるだけでもエラーから回復するのが楽になりそうです。
From: Transactional NTFS (1)