調べた結果、以下のような方向にしようと思います。
この結果、メッセージボックスのサイズは512GBまでになります*1。ただし、FATの場合には一つのファイルの最大サイズは4GBになります。この場合でも、4GBまでのサイズでmsg.boxの分割をした場合には、512GBまで使えます。
*1 msg.boxは128バイトごとのクラスタに分割されていて、(2)のインデックスはクラスタのインデックスなので、128*4GB=512GB